Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
RANGAP1P46060 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
RANGAP1P46060 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RANGAP1P46060 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms