Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBP1P32455 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBP1P32455 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GBP1P32455 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBP1P32455 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBP1P32455 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBP1P32455 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBP1P32455 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBP1P32455 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBP1P32455 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBP1P32455 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBP1P32455 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBP1P32455 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBP1P32455 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBP1P32455 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBP1P32455 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBP1P32455 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBP1P32455 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GBP1P32455 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GBP1P32455 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBP1P32455 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBP1P32455 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GBP1P32455 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBP1P32455 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GBP1P32455 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBP1P32455 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GBP1P32455 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBP1P32455 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBP1P32455 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GBP1P32455 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GBP1P32455 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBP1P32455 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBP1P32455 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBP1P32455 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBP1P32455 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBP1P32455 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBP1P32455 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GBP1P32455 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBP1P32455 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBP1P32455 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBP1P32455 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBP1P32455 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBP1P32455 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBP1P32455 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBP1P32455 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBP1P32455 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBP1P32455 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBP1P32455 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBP1P32455 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBP1P32455 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBP1P32455 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GBP1P32455 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBP1P32455 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBP1P32455 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBP1P32455 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBP1P32455 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBP1P32455 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBP1P32455 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBP1P32455 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBP1P32455 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBP1P32455 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBP1P32455 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBP1P32455 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBP1P32455 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBP1P32455 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBP1P32455 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBP1P32455 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBP1P32455 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBP1P32455 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBP1P32455 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBP1P32455 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBP1P32455 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBP1P32455 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBP1P32455 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBP1P32455 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBP1P32455 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBP1P32455 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBP1P32455 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GBP1P32455 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GBP1P32455 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBP1P32455 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBP1P32455 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBP1P32455 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBP1P32455 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBP1P32455 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBP1P32455 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBP1P32455 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBP1P32455 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBP1P32455 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBP1P32455 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBP1P32455 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBP1P32455 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBP1P32455 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBP1P32455 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBP1P32455 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBP1P32455 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP1P32455 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP1P32455 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP1P32455 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP1P32455 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms