Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPREP23469 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPREP23469 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPREP23469 LINC02472-201ENST00000512268 575 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPREP23469 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPREP23469 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPREP23469 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPREP23469 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPREP23469 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPREP23469 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPREP23469 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPREP23469 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPREP23469 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPREP23469 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPREP23469 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPREP23469 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPREP23469 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPREP23469 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPREP23469 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPREP23469 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPREP23469 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPREP23469 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPREP23469 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPREP23469 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPREP23469 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPREP23469 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPREP23469 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPREP23469 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPREP23469 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPREP23469 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPREP23469 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPREP23469 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPREP23469 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPREP23469 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPREP23469 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPREP23469 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPREP23469 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPREP23469 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPREP23469 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPREP23469 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPREP23469 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPREP23469 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPREP23469 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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PTPREP23469 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPREP23469 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPREP23469 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPREP23469 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPREP23469 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPREP23469 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPREP23469 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPREP23469 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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PTPREP23469 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPREP23469 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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PTPREP23469 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPREP23469 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPREP23469 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPREP23469 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPREP23469 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPREP23469 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPREP23469 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPREP23469 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPREP23469 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPREP23469 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPREP23469 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPREP23469 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPREP23469 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPREP23469 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPREP23469 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPREP23469 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPREP23469 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPREP23469 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPREP23469 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPREP23469 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPREP23469 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPREP23469 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPREP23469 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPREP23469 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPREP23469 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPREP23469 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPREP23469 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPREP23469 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPREP23469 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPREP23469 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPREP23469 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPREP23469 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPREP23469 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPREP23469 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPREP23469 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPREP23469 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPREP23469 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPREP23469 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPREP23469 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPREP23469 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPREP23469 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPREP23469 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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