Protein–RNA interactions for Protein: P13646

KRT13, Keratin, type I cytoskeletal 13, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT13P13646 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KRT13P13646 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KRT13P13646 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KRT13P13646 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KRT13P13646 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KRT13P13646 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KRT13P13646 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KRT13P13646 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KRT13P13646 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KRT13P13646 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KRT13P13646 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KRT13P13646 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KRT13P13646 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KRT13P13646 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KRT13P13646 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KRT13P13646 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KRT13P13646 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KRT13P13646 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KRT13P13646 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KRT13P13646 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KRT13P13646 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KRT13P13646 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KRT13P13646 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KRT13P13646 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT13P13646 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT13P13646 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT13P13646 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT13P13646 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT13P13646 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT13P13646 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT13P13646 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT13P13646 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT13P13646 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT13P13646 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT13P13646 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT13P13646 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT13P13646 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT13P13646 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT13P13646 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT13P13646 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT13P13646 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT13P13646 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT13P13646 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT13P13646 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT13P13646 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT13P13646 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT13P13646 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT13P13646 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT13P13646 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT13P13646 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT13P13646 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT13P13646 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT13P13646 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT13P13646 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT13P13646 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT13P13646 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT13P13646 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT13P13646 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT13P13646 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT13P13646 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT13P13646 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT13P13646 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT13P13646 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT13P13646 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT13P13646 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT13P13646 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT13P13646 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT13P13646 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT13P13646 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT13P13646 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT13P13646 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT13P13646 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT13P13646 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT13P13646 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT13P13646 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT13P13646 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT13P13646 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT13P13646 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT13P13646 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT13P13646 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT13P13646 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT13P13646 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT13P13646 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT13P13646 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT13P13646 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT13P13646 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT13P13646 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT13P13646 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT13P13646 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT13P13646 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT13P13646 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT13P13646 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT13P13646 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT13P13646 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT13P13646 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT13P13646 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT13P13646 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT13P13646 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT13P13646 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT13P13646 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms