Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW5

SMIM10L2B, Small integral membrane protein 10-like protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2BP0DMW5 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms