Protein–RNA interactions for Protein: P09497

CLTB, Clathrin light chain B, humanhuman

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTBP09497 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CLTBP09497 AC233280.19-201ENST00000633223 136 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CLTBP09497 GNG14-201ENST00000640117 210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLTBP09497 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLTBP09497 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLTBP09497 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLTBP09497 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLTBP09497 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLTBP09497 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLTBP09497 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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CLTBP09497 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLTBP09497 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLTBP09497 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLTBP09497 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLTBP09497 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
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CLTBP09497 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLTBP09497 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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CLTBP09497 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLTBP09497 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLTBP09497 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLTBP09497 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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CLTBP09497 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLTBP09497 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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CLTBP09497 AC114812.1-201ENST00000421868 689 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLTBP09497 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLTBP09497 SOD2-205ENST00000444946 917 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLTBP09497 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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CLTBP09497 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLTBP09497 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLTBP09497 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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CLTBP09497 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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CLTBP09497 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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CLTBP09497 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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CLTBP09497 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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CLTBP09497 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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CLTBP09497 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLTBP09497 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLTBP09497 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLTBP09497 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLTBP09497 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLTBP09497 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLTBP09497 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLTBP09497 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLTBP09497 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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CLTBP09497 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLTBP09497 AL359853.1-202ENST00000415218 544 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLTBP09497 LINC01656-201ENST00000415702 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLTBP09497 AL356417.1-201ENST00000421161 845 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLTBP09497 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLTBP09497 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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