Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms