Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 AP003040.1-201ENST00000532044 1024 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAPPC8Q9Y2L5 AC142086.5-202ENST00000562500 217 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01029-202ENST00000578833 366 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAPPC8Q9Y2L5 RN7SL524P-201ENST00000581152 300 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAPPC8Q9Y2L5 AC012593.1-214ENST00000586952 767 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAPPC8Q9Y2L5 PRKACA-208ENST00000589994 1127 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAPPC8Q9Y2L5 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAPPC8Q9Y2L5 STAG3L1-204ENST00000619870 1192 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAPPC8Q9Y2L5 AP003900.1-201ENST00000622592 859 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAPPC8Q9Y2L5 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAPPC8Q9Y2L5 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAPPC8Q9Y2L5 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAPPC8Q9Y2L5 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAPPC8Q9Y2L5 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAPPC8Q9Y2L5 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAPPC8Q9Y2L5 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAPPC8Q9Y2L5 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAPPC8Q9Y2L5 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAPPC8Q9Y2L5 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAPPC8Q9Y2L5 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAPPC8Q9Y2L5 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAPPC8Q9Y2L5 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAPPC8Q9Y2L5 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAPPC8Q9Y2L5 SIGLEC6-204ENST00000391797 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAPPC8Q9Y2L5 LILRP2-202ENST00000413572 1383 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAPPC8Q9Y2L5 HFE-209ENST00000461397 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAPPC8Q9Y2L5 RPSAP70-201ENST00000504462 864 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAPPC8Q9Y2L5 SMAD1-AS1-201ENST00000513542 481 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAPPC8Q9Y2L5 TRAPPC2L-212ENST00000567312 499 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAPPC8Q9Y2L5 YWHAE-212ENST00000575977 540 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01836-201ENST00000586061 829 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAPPC8Q9Y2L5 AC123912.6-201ENST00000612657 315 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR6125-201ENST00000618986 96 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAPPC8Q9Y2L5 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAPPC8Q9Y2L5 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAPPC8Q9Y2L5 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAPPC8Q9Y2L5 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAPPC8Q9Y2L5 APOBEC3A-201ENST00000249116 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAPPC8Q9Y2L5 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAPPC8Q9Y2L5 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAPPC8Q9Y2L5 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAPPC8Q9Y2L5 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAPPC8Q9Y2L5 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAPPC8Q9Y2L5 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAPPC8Q9Y2L5 CHRNA1-205ENST00000409542 1460 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAPPC8Q9Y2L5 GPN3-203ENST00000543199 1604 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAPPC8Q9Y2L5 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAPPC8Q9Y2L5 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAPPC8Q9Y2L5 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAPPC8Q9Y2L5 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAPPC8Q9Y2L5 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAPPC8Q9Y2L5 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAPPC8Q9Y2L5 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAPPC8Q9Y2L5 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAPPC8Q9Y2L5 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAPPC8Q9Y2L5 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAPPC8Q9Y2L5 GLRX2-202ENST00000367440 1131 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAPPC8Q9Y2L5 HDGF-202ENST00000368206 960 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAPPC8Q9Y2L5 AL359649.1-202ENST00000375713 443 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAPPC8Q9Y2L5 PTGR1-205ENST00000407693 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAPPC8Q9Y2L5 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAPPC8Q9Y2L5 SAPCD1-AS1-202ENST00000419679 461 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAPPC8Q9Y2L5 AC092910.2-201ENST00000491262 348 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAPPC8Q9Y2L5 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAPPC8Q9Y2L5 AF274856.1-202ENST00000509345 871 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAPPC8Q9Y2L5 AL162231.1-205ENST00000544078 338 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAPPC8Q9Y2L5 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAPPC8Q9Y2L5 CCND3P2-201ENST00000579393 537 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF671-203ENST00000596939 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAPPC8Q9Y2L5 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT37-201ENST00000225550 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAPPC8Q9Y2L5 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAPPC8Q9Y2L5 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAPPC8Q9Y2L5 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAPPC8Q9Y2L5 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAPPC8Q9Y2L5 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAPPC8Q9Y2L5 HLF-202ENST00000430986 1385 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAPPC8Q9Y2L5 HNRNPC-205ENST00000553300 1375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAPPC8Q9Y2L5 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAPPC8Q9Y2L5 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAPPC8Q9Y2L5 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAPPC8Q9Y2L5 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAPPC8Q9Y2L5 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAPPC8Q9Y2L5 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAPPC8Q9Y2L5 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAPPC8Q9Y2L5 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAPPC8Q9Y2L5 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAPPC8Q9Y2L5 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01885-201ENST00000414300 609 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT18P44-201ENST00000416086 1285 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM197Y6-201ENST00000420524 766 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAPPC8Q9Y2L5 AL121656.1-201ENST00000440786 482 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAPPC8Q9Y2L5 WNT5B-206ENST00000542408 508 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms