Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms