Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCN3

TMEM8A, Post-GPI attachment to proteins factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM8AQ9HCN3 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM8AQ9HCN3 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM8AQ9HCN3 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM8AQ9HCN3 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM8AQ9HCN3 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM8AQ9HCN3 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM8AQ9HCN3 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM8AQ9HCN3 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM8AQ9HCN3 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM8AQ9HCN3 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM8AQ9HCN3 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM8AQ9HCN3 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM8AQ9HCN3 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM8AQ9HCN3 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM8AQ9HCN3 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM8AQ9HCN3 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM8AQ9HCN3 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM8AQ9HCN3 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM8AQ9HCN3 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM8AQ9HCN3 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM8AQ9HCN3 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM8AQ9HCN3 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM8AQ9HCN3 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM8AQ9HCN3 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM8AQ9HCN3 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM8AQ9HCN3 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM8AQ9HCN3 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM8AQ9HCN3 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM8AQ9HCN3 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM8AQ9HCN3 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM8AQ9HCN3 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM8AQ9HCN3 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM8AQ9HCN3 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM8AQ9HCN3 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM8AQ9HCN3 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM8AQ9HCN3 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM8AQ9HCN3 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM8AQ9HCN3 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM8AQ9HCN3 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM8AQ9HCN3 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM8AQ9HCN3 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM8AQ9HCN3 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM8AQ9HCN3 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM8AQ9HCN3 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM8AQ9HCN3 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM8AQ9HCN3 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM8AQ9HCN3 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM8AQ9HCN3 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM8AQ9HCN3 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM8AQ9HCN3 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM8AQ9HCN3 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM8AQ9HCN3 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM8AQ9HCN3 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM8AQ9HCN3 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM8AQ9HCN3 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM8AQ9HCN3 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM8AQ9HCN3 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM8AQ9HCN3 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM8AQ9HCN3 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM8AQ9HCN3 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM8AQ9HCN3 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM8AQ9HCN3 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM8AQ9HCN3 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM8AQ9HCN3 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM8AQ9HCN3 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM8AQ9HCN3 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM8AQ9HCN3 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM8AQ9HCN3 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM8AQ9HCN3 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM8AQ9HCN3 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM8AQ9HCN3 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM8AQ9HCN3 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM8AQ9HCN3 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM8AQ9HCN3 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM8AQ9HCN3 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM8AQ9HCN3 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM8AQ9HCN3 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM8AQ9HCN3 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM8AQ9HCN3 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM8AQ9HCN3 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM8AQ9HCN3 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM8AQ9HCN3 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM8AQ9HCN3 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM8AQ9HCN3 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM8AQ9HCN3 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM8AQ9HCN3 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM8AQ9HCN3 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM8AQ9HCN3 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM8AQ9HCN3 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM8AQ9HCN3 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM8AQ9HCN3 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM8AQ9HCN3 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM8AQ9HCN3 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM8AQ9HCN3 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM8AQ9HCN3 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM8AQ9HCN3 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM8AQ9HCN3 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM8AQ9HCN3 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM8AQ9HCN3 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM8AQ9HCN3 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms