Protein–RNA interactions for Protein: Q99653

CHP1, Calcineurin B homologous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHP1Q99653 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms