Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 LPGAT1-201ENST00000366996 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TOPBP1Q92547 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TOPBP1Q92547 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TOPBP1Q92547 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TOPBP1Q92547 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TOPBP1Q92547 UBE2V1-222ENST00000557021 2258 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TOPBP1Q92547 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TOPBP1Q92547 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TOPBP1Q92547 CASP8-212ENST00000432109 1629 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TOPBP1Q92547 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TOPBP1Q92547 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TOPBP1Q92547 INMT-202ENST00000409539 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TOPBP1Q92547 AL162151.1-201ENST00000423922 561 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TOPBP1Q92547 MTHFD2P7-201ENST00000483867 983 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TOPBP1Q92547 CTB-178M22.2-201ENST00000519795 503 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TOPBP1Q92547 AP003071.1-201ENST00000567925 622 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TOPBP1Q92547 SMIM28-201ENST00000573100 855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TOPBP1Q92547 AC022001.3-201ENST00000606330 596 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TOPBP1Q92547 MCRS1-203ENST00000546244 1686 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TOPBP1Q92547 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TOPBP1Q92547 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TOPBP1Q92547 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TOPBP1Q92547 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TOPBP1Q92547 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TOPBP1Q92547 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TOPBP1Q92547 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TOPBP1Q92547 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TOPBP1Q92547 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TOPBP1Q92547 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TOPBP1Q92547 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TOPBP1Q92547 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TOPBP1Q92547 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TOPBP1Q92547 ARCN1-204ENST00000534182 1669 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TOPBP1Q92547 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TOPBP1Q92547 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TOPBP1Q92547 UBE2A-206ENST00000625938 1381 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TOPBP1Q92547 GAST-201ENST00000329402 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TOPBP1Q92547 MRPL48-203ENST00000398483 1058 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TOPBP1Q92547 LINC02026-202ENST00000414309 772 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TOPBP1Q92547 AC092865.2-201ENST00000439409 971 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TOPBP1Q92547 AC114812.4-201ENST00000506676 757 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TOPBP1Q92547 AC120498.5-201ENST00000561757 299 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TOPBP1Q92547 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TOPBP1Q92547 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TOPBP1Q92547 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TOPBP1Q92547 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TOPBP1Q92547 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TOPBP1Q92547 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TOPBP1Q92547 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TOPBP1Q92547 FAM133B-204ENST00000445716 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TOPBP1Q92547 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TOPBP1Q92547 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TOPBP1Q92547 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TOPBP1Q92547 LINC00682-202ENST00000499082 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TOPBP1Q92547 LINC01922-202ENST00000567168 1704 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TOPBP1Q92547 PAX5-203ENST00000377847 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TOPBP1Q92547 CYCS-203ENST00000409764 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TOPBP1Q92547 AC091729.3-203ENST00000413706 674 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TOPBP1Q92547 IQSEC2-205ENST00000498281 673 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TOPBP1Q92547 PAX5-213ENST00000523145 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TOPBP1Q92547 TRAPPC4-212ENST00000533058 1209 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TOPBP1Q92547 AC010183.1-201ENST00000552413 559 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TOPBP1Q92547 CKAP2-202ENST00000378034 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TOPBP1Q92547 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TOPBP1Q92547 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TOPBP1Q92547 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TOPBP1Q92547 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TOPBP1Q92547 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TOPBP1Q92547 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TOPBP1Q92547 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TOPBP1Q92547 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TOPBP1Q92547 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TOPBP1Q92547 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TOPBP1Q92547 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TOPBP1Q92547 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TOPBP1Q92547 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TOPBP1Q92547 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TOPBP1Q92547 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TOPBP1Q92547 MUC1-207ENST00000368392 1032 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TOPBP1Q92547 MUC1-208ENST00000368393 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TOPBP1Q92547 CFL1P6-201ENST00000400899 494 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TOPBP1Q92547 THAP4-203ENST00000402545 833 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TOPBP1Q92547 SNORD88B-201ENST00000408454 91 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TOPBP1Q92547 AC078882.1-201ENST00000436132 416 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TOPBP1Q92547 AC005077.3-201ENST00000449614 213 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TOPBP1Q92547 LINC01875-201ENST00000454477 660 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TOPBP1Q92547 MUC1-213ENST00000462215 1189 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TOPBP1Q92547 TMA16-204ENST00000508268 608 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TOPBP1Q92547 ANAPC15-209ENST00000538919 849 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TOPBP1Q92547 TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 562 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TOPBP1Q92547 AC140912.1-202ENST00000561802 194 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TOPBP1Q92547 Metazoa_SRP.147-201ENST00000576563 312 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TOPBP1Q92547 RN7SL202P-201ENST00000584410 262 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TOPBP1Q92547 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TOPBP1Q92547 TGM1-202ENST00000544573 1581 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TOPBP1Q92547 RFPL3-201ENST00000249007 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TOPBP1Q92547 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TOPBP1Q92547 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TOPBP1Q92547 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms