Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 AL137244.1-201ENST00000422931 865 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 AC087071.1-201ENST00000469264 427 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 AC113347.2-201ENST00000512350 279 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 GABARAPL1-213ENST00000544284 531 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 MT3-202ENST00000561640 514 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 AC019294.2-203ENST00000569596 594 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 ZFP36-201ENST00000594045 690 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 OR2T11-201ENST00000625105 1072 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 MAD2L1BP-202ENST00000451025 1517 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 SNORA57-201ENST00000383870 149 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 ACTBP14-201ENST00000411655 1089 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 AL359853.1-202ENST00000415218 544 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 LINC01656-201ENST00000415702 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 AL137026.2-201ENST00000437014 841 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 AC073896.4-201ENST00000553176 403 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 AC120498.7-201ENST00000562876 330 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 AC087741.1-204ENST00000573935 646 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 RN7SL605P-201ENST00000577229 281 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 AC126755.5-201ENST00000622756 267 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 FCN2-202ENST00000350339 943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERVK_113Q902F9 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms