Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBC4

UBA3, NEDD8-activating enzyme E1 catalytic subunit, humanhuman

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA3Q8TBC4 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBA3Q8TBC4 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBA3Q8TBC4 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBA3Q8TBC4 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBA3Q8TBC4 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBA3Q8TBC4 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBA3Q8TBC4 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBA3Q8TBC4 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBA3Q8TBC4 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBA3Q8TBC4 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBA3Q8TBC4 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBA3Q8TBC4 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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UBA3Q8TBC4 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
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UBA3Q8TBC4 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBA3Q8TBC4 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBA3Q8TBC4 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBA3Q8TBC4 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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UBA3Q8TBC4 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBA3Q8TBC4 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBA3Q8TBC4 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBA3Q8TBC4 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBA3Q8TBC4 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
UBA3Q8TBC4 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBA3Q8TBC4 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBA3Q8TBC4 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBA3Q8TBC4 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBA3Q8TBC4 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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UBA3Q8TBC4 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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UBA3Q8TBC4 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBA3Q8TBC4 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBA3Q8TBC4 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
UBA3Q8TBC4 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
UBA3Q8TBC4 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBA3Q8TBC4 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBA3Q8TBC4 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBA3Q8TBC4 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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UBA3Q8TBC4 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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UBA3Q8TBC4 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBA3Q8TBC4 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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UBA3Q8TBC4 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBA3Q8TBC4 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBA3Q8TBC4 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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UBA3Q8TBC4 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBA3Q8TBC4 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBA3Q8TBC4 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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UBA3Q8TBC4 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBA3Q8TBC4 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBA3Q8TBC4 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBA3Q8TBC4 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBA3Q8TBC4 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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UBA3Q8TBC4 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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UBA3Q8TBC4 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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UBA3Q8TBC4 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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UBA3Q8TBC4 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBA3Q8TBC4 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
UBA3Q8TBC4 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBA3Q8TBC4 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBA3Q8TBC4 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBA3Q8TBC4 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBA3Q8TBC4 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBA3Q8TBC4 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBA3Q8TBC4 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBA3Q8TBC4 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBA3Q8TBC4 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBA3Q8TBC4 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
UBA3Q8TBC4 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBA3Q8TBC4 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBA3Q8TBC4 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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