Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 AC112176.1-201ENST00000565428 3024 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 TBC1D13-202ENST00000372648 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 MDH2-204ENST00000443006 2020 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 SRP72-205ENST00000510663 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 CYP4F11-205ENST00000620614 2908 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 PNMA5-203ENST00000439251 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 HSPA8P9-201ENST00000485881 1943 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 PAX8-203ENST00000348715 3966 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 RBM10-206ENST00000628161 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 KLC4-201ENST00000259708 2688 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 PLAT-202ENST00000352041 2516 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 AGAP12P-202ENST00000603888 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 AC092117.1-201ENST00000621230 3250 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 CADM1-206ENST00000537058 3550 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 NEK11-209ENST00000510688 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 NFATC2IP-206ENST00000568148 1157 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 DDR1-262ENST00000508312 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 MYO1D-206ENST00000579584 3500 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 PYGM-201ENST00000164139 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 DLGAP2-201ENST00000421627 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 CELF4-218ENST00000591287 3757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 CCT6P3-201ENST00000419314 3702 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 AL354861.3-201ENST00000600140 2412 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 USB1-207ENST00000563149 1751 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 SPCS2-209ENST00000610881 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 CPT1A-205ENST00000539743 2382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 CST3-203ENST00000398411 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 POLL-202ENST00000339310 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 SEC24B-202ENST00000399100 3780 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 DDX11-223ENST00000542838 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 CAST-223ENST00000508608 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 EPS15L1-201ENST00000248070 2924 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 CIZ1-205ENST00000372948 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 CHGB-201ENST00000378961 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 BRAP-202ENST00000419234 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 MCU-204ENST00000536019 3224 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 TBC1D26-201ENST00000437605 1868 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms