Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2C8

MED27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED27Q6P2C8 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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MED27Q6P2C8 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
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MED27Q6P2C8 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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MED27Q6P2C8 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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MED27Q6P2C8 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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MED27Q6P2C8 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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MED27Q6P2C8 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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MED27Q6P2C8 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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