Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT06

CEP350, Centrosome-associated protein 350, humanhuman

Predictions only

Length 3,117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP350Q5VT06 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 RPSAP69-201ENST00000445739 546 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 AL137028.2-201ENST00000614601 256 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 NOS2P3-201ENST00000411468 867 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 AC064853.1-201ENST00000413096 540 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 CDA-201ENST00000375071 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 PRAMEF35P-201ENST00000458709 891 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 BNC2-207ENST00000471301 745 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 IGKV3-11-201ENST00000483158 392 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 AC022217.2-201ENST00000518941 472 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 AC044839.1-201ENST00000532307 541 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 SH3GLB2-206ENST00000417224 1468 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 CACNA2D4-209ENST00000538450 1498 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 AC023509.3-202ENST00000591834 1609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 RAB13-201ENST00000368575 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 MRPL55-219ENST00000391867 685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 VTI1BP2-201ENST00000394154 696 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 HNRNPA1P3-201ENST00000440968 551 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 AC009238.3-201ENST00000512705 217 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 GH2-205ENST00000622506 702 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 TCP10-205ENST00000476779 646 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 CST7-201ENST00000480798 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 AC089987.3-201ENST00000551847 588 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 AC090825.2-201ENST00000557959 739 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 B9D1-213ENST00000575403 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 AC116036.2-201ENST00000607592 462 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 SLC50A1-214ENST00000622581 1245 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 FAM157C-201ENST00000563357 1806 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 APOC2-201ENST00000252490 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 AC098649.1-201ENST00000427258 569 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 SMIM26-202ENST00000435844 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 FLNC-AS1-201ENST00000469965 559 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 NREP-218ENST00000509427 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 AC112250.1-201ENST00000504640 745 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 AL121790.2-201ENST00000553425 379 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 AC005096.1-201ENST00000560499 622 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 AC092535.4-201ENST00000609548 397 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 AL139220.2-222ENST00000627999 756 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 BIN3-212ENST00000640731 450 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms