Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 NOS3-201ENST00000297494 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 ACO2-202ENST00000396512 2811 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 KIAA1549-202ENST00000440172 12379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 MIR34AHG-203ENST00000635687 4211 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 SLC12A6-205ENST00000458406 4425 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 PALLD-209ENST00000507735 4379 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 SNX14-201ENST00000314673 3486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 ZNF606-201ENST00000341164 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 AC073957.3-201ENST00000609998 6758 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 NLRP2-204ENST00000391721 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 OSTM1-AS1-202ENST00000441184 3334 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 PPARGC1B-202ENST00000360453 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 TMBIM1-202ENST00000396809 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 VASH2-203ENST00000366965 3572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 ALDH18A1-202ENST00000371224 3359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 TPR-201ENST00000367478 9708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 LINC00384-201ENST00000437721 6852 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 IYD-208ENST00000500320 2158 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 LINC00343-203ENST00000454555 1765 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 CFAP65-208ENST00000453220 5877 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 SCAF8-203ENST00000417268 4944 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 MAP4-204ENST00000395734 5590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 DPY19L2P2-205ENST00000439473 3994 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 PIAS2-201ENST00000324794 4543 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 ARHGEF1-203ENST00000354532 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 AC036108.2-201ENST00000566974 2562 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 CCDC60-201ENST00000327554 2450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 SPTBN2-201ENST00000309996 7866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 ZNF197-204ENST00000383745 2935 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 SLC25A25-204ENST00000373069 3376 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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