Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 AL591499.1-201ENST00000307155 1153 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 POP5-201ENST00000341039 913 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 AL162151.1-201ENST00000423922 561 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 ACTG1P23-201ENST00000437653 1074 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 AP005273.1-201ENST00000444862 522 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 AL358215.1-201ENST00000481350 482 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 RN7SL363P-201ENST00000482412 273 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 ALDOAP1-201ENST00000491506 1078 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 AL450346.2-201ENST00000495602 1024 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 AL139099.3-201ENST00000556657 401 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 CYB5D2-202ENST00000573984 495 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 Metazoa_SRP.153-201ENST00000620153 341 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 GNG4-201ENST00000366597 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 TGM1-202ENST00000544573 1581 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 TP63-206ENST00000392463 1386 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 Z82195.2-202ENST00000458525 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 WNT8A-202ENST00000398754 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 TRO-225ENST00000622017 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 LXN-201ENST00000264265 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 OR7E12P-201ENST00000344740 973 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 VKORC1-203ENST00000354895 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 HAND2-AS1-208ENST00000504740 837 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 IFI27L1-211ENST00000557066 580 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 AL136295.3-201ENST00000558325 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 MBIP-211ENST00000621657 1809 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS72Q15906 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
VPS72Q15906 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
VPS72Q15906 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
VPS72Q15906 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
VPS72Q15906 SAP18-201ENST00000382533 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS72Q15906 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS72Q15906 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS72Q15906 AL031590.1-202ENST00000641466 1737 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS72Q15906 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS72Q15906 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS72Q15906 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS72Q15906 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS72Q15906 PROZ-201ENST00000342783 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS72Q15906 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS72Q15906 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS72Q15906 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS72Q15906 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS72Q15906 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS72Q15906 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS72Q15906 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS72Q15906 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS72Q15906 RPLP1-202ENST00000357790 445 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS72Q15906 COA6-201ENST00000366612 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS72Q15906 TCEAL5-201ENST00000372680 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS72Q15906 U3.41-201ENST00000408711 219 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS72Q15906 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS72Q15906 AP002495.1-205ENST00000529513 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS72Q15906 AC007223.1-201ENST00000564076 572 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS72Q15906 AC090617.4-201ENST00000572404 422 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS72Q15906 DERL2-206ENST00000572834 589 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS72Q15906 SEPT4-AS1-203ENST00000580769 1000 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS72Q15906 AC138150.1-201ENST00000589950 570 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS72Q15906 HIST1H3E-201ENST00000614911 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS72Q15906 PAX8-AS1-219ENST00000623306 840 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS72Q15906 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS72Q15906 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS72Q15906 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS72Q15906 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS72Q15906 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS72Q15906 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS72Q15906 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS72Q15906 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS72Q15906 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS72Q15906 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
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