Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITSN1Q15811 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ITSN1Q15811 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITSN1Q15811 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ITSN1Q15811 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITSN1Q15811 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITSN1Q15811 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITSN1Q15811 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITSN1Q15811 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITSN1Q15811 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITSN1Q15811 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITSN1Q15811 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ITSN1Q15811 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ITSN1Q15811 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ITSN1Q15811 ELFN1-AS1-201ENST00000415399 636 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ITSN1Q15811 WWC2-208ENST00000508747 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ITSN1Q15811 SMAD1-AS1-201ENST00000513542 481 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ITSN1Q15811 WNT5B-206ENST00000542408 508 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ITSN1Q15811 AC090617.4-201ENST00000572404 422 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ITSN1Q15811 YWHAE-212ENST00000575977 540 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ITSN1Q15811 SEPT14P19-201ENST00000587432 336 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ITSN1Q15811 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ITSN1Q15811 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ITSN1Q15811 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ITSN1Q15811 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ITSN1Q15811 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ITSN1Q15811 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ITSN1Q15811 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ITSN1Q15811 ATP6V1C1-205ENST00000521514 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ITSN1Q15811 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ITSN1Q15811 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ITSN1Q15811 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ITSN1Q15811 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ITSN1Q15811 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ITSN1Q15811 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ITSN1Q15811 C1orf87-202ENST00000450089 1307 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ITSN1Q15811 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ITSN1Q15811 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ITSN1Q15811 KCTD6-205ENST00000490264 1759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ITSN1Q15811 SELENBP1-208ENST00000447402 1530 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ITSN1Q15811 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ITSN1Q15811 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ITSN1Q15811 MPV17-207ENST00000403262 665 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ITSN1Q15811 AL157823.1-201ENST00000403727 628 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ITSN1Q15811 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ITSN1Q15811 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ITSN1Q15811 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ITSN1Q15811 AL121656.1-201ENST00000440786 482 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ITSN1Q15811 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ITSN1Q15811 HNRNPA3P6-201ENST00000472163 1006 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ITSN1Q15811 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ITSN1Q15811 SRP54-AS1-204ENST00000556705 580 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ITSN1Q15811 LINC01996-201ENST00000573270 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ITSN1Q15811 RN7SL134P-201ENST00000579756 303 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ITSN1Q15811 AC090510.3-201ENST00000615831 821 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ITSN1Q15811 AC011462.4-201ENST00000616866 449 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ITSN1Q15811 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ITSN1Q15811 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ITSN1Q15811 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITSN1Q15811 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITSN1Q15811 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITSN1Q15811 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITSN1Q15811 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITSN1Q15811 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITSN1Q15811 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITSN1Q15811 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITSN1Q15811 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITSN1Q15811 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITSN1Q15811 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITSN1Q15811 OLFML2B-202ENST00000367938 1153 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITSN1Q15811 AL158207.2-201ENST00000414926 266 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITSN1Q15811 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITSN1Q15811 BX248123.1-201ENST00000429070 606 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITSN1Q15811 AC093700.1-201ENST00000503348 717 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ITSN1Q15811 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITSN1Q15811 MCM8-AS1-201ENST00000613522 983 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITSN1Q15811 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITSN1Q15811 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITSN1Q15811 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITSN1Q15811 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITSN1Q15811 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITSN1Q15811 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITSN1Q15811 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITSN1Q15811 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITSN1Q15811 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ITSN1Q15811 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITSN1Q15811 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITSN1Q15811 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITSN1Q15811 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITSN1Q15811 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITSN1Q15811 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITSN1Q15811 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITSN1Q15811 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITSN1Q15811 CITED1-209ENST00000453707 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITSN1Q15811 TMEM14B-215ENST00000481240 1032 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITSN1Q15811 HNRNPA1P56-201ENST00000505767 954 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ITSN1Q15811 AC009055.1-201ENST00000562656 781 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITSN1Q15811 AC079414.2-201ENST00000567157 1104 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ITSN1Q15811 FBXO36P1-201ENST00000579006 471 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ITSN1Q15811 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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