Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 LPCAT2-201ENST00000262134 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 ANTXR2-203ENST00000403729 8273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 APLP2-202ENST00000278756 3687 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 ZFAND3-203ENST00000373391 3001 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 ESYT1-202ENST00000394048 4388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 TBX3-201ENST00000257566 4208 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 TBC1D8B-202ENST00000310452 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 SPCS3-201ENST00000503362 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 DCAF11-204ENST00000446197 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 BCL2L2-201ENST00000250405 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 NRP2-204ENST00000360409 6662 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 KLF7-204ENST00000423015 1788 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 INTS13-201ENST00000261191 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 IFT172-203ENST00000416524 1982 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 KLHL7-202ENST00000339077 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 NRP2-202ENST00000357118 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 FAM53B-203ENST00000392754 3557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 SMARCA4-205ENST00000450717 5506 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 NOA1-201ENST00000264230 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 TRPM4-202ENST00000427978 3444 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 RAB11FIP1-202ENST00000330843 7811 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 ZEB2-204ENST00000409487 5361 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 TP73-203ENST00000357733 4899 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 CACNA1C-214ENST00000399634 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 TMBIM1-202ENST00000396809 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 SMG9-201ENST00000270066 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 SLC44A1-202ENST00000374723 9640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 ANGPTL2-201ENST00000373417 2575 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 CAPN1-202ENST00000524773 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 FAM102A-202ENST00000373084 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 SLC5A8-201ENST00000536262 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 STAT3-203ENST00000404395 2633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
TAF11Q15544 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms