Protein–RNA interactions for Protein: Q14623

IHH, Indian hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IHHQ14623 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
IHHQ14623 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
IHHQ14623 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
IHHQ14623 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
IHHQ14623 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
IHHQ14623 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
IHHQ14623 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
IHHQ14623 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
IHHQ14623 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
IHHQ14623 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
IHHQ14623 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
IHHQ14623 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
IHHQ14623 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
IHHQ14623 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
IHHQ14623 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
IHHQ14623 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
IHHQ14623 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
IHHQ14623 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
IHHQ14623 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
IHHQ14623 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
IHHQ14623 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
IHHQ14623 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
IHHQ14623 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
IHHQ14623 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
IHHQ14623 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
IHHQ14623 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
IHHQ14623 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
IHHQ14623 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
IHHQ14623 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
IHHQ14623 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
IHHQ14623 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
IHHQ14623 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
IHHQ14623 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
IHHQ14623 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
IHHQ14623 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
IHHQ14623 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
IHHQ14623 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
IHHQ14623 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
IHHQ14623 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
IHHQ14623 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
IHHQ14623 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
IHHQ14623 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
IHHQ14623 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
IHHQ14623 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
IHHQ14623 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
IHHQ14623 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
IHHQ14623 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
IHHQ14623 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
IHHQ14623 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
IHHQ14623 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
IHHQ14623 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
IHHQ14623 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
IHHQ14623 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
IHHQ14623 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IHHQ14623 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IHHQ14623 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IHHQ14623 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IHHQ14623 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
IHHQ14623 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IHHQ14623 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
IHHQ14623 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IHHQ14623 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IHHQ14623 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IHHQ14623 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IHHQ14623 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IHHQ14623 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
IHHQ14623 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IHHQ14623 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IHHQ14623 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IHHQ14623 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IHHQ14623 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IHHQ14623 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IHHQ14623 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IHHQ14623 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IHHQ14623 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
IHHQ14623 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IHHQ14623 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IHHQ14623 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IHHQ14623 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IHHQ14623 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IHHQ14623 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IHHQ14623 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IHHQ14623 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IHHQ14623 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IHHQ14623 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
IHHQ14623 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IHHQ14623 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IHHQ14623 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IHHQ14623 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IHHQ14623 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IHHQ14623 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IHHQ14623 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IHHQ14623 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IHHQ14623 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IHHQ14623 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IHHQ14623 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IHHQ14623 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IHHQ14623 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IHHQ14623 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IHHQ14623 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms