Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
APOFQ13790 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
APOFQ13790 SKP2-209ENST00000620197 3255 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
APOFQ13790 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
APOFQ13790 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
APOFQ13790 TVP23A-201ENST00000299866 3360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
APOFQ13790 ANKRD20A1-201ENST00000562196 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
APOFQ13790 ZNF774-201ENST00000354377 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
APOFQ13790 TRMT61A-202ENST00000389749 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
APOFQ13790 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
APOFQ13790 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
APOFQ13790 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
APOFQ13790 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
APOFQ13790 GPR107-208ENST00000610997 2813 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
APOFQ13790 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
APOFQ13790 SRP54-201ENST00000216774 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
APOFQ13790 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
APOFQ13790 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
APOFQ13790 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
APOFQ13790 RERG-204ENST00000536465 2134 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
APOFQ13790 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
APOFQ13790 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
APOFQ13790 HERC3-203ENST00000407637 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
APOFQ13790 GRIA4-210ENST00000527669 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
APOFQ13790 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
APOFQ13790 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
APOFQ13790 FGGY-201ENST00000303721 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
APOFQ13790 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
APOFQ13790 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
APOFQ13790 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
APOFQ13790 AC000120.1-201ENST00000414227 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
APOFQ13790 SLC25A18-202ENST00000399813 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
APOFQ13790 TBC1D8B-202ENST00000310452 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
APOFQ13790 KCNJ11-201ENST00000339994 2801 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
APOFQ13790 NCDN-201ENST00000356090 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
APOFQ13790 ZNF595-205ENST00000610261 2911 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
APOFQ13790 DNAJC14-202ENST00000317287 2774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
APOFQ13790 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
APOFQ13790 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
APOFQ13790 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
APOFQ13790 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
APOFQ13790 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
APOFQ13790 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
APOFQ13790 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
APOFQ13790 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
APOFQ13790 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
APOFQ13790 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
APOFQ13790 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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APOFQ13790 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
APOFQ13790 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
APOFQ13790 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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APOFQ13790 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
APOFQ13790 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
APOFQ13790 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
APOFQ13790 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
APOFQ13790 XRCC6-201ENST00000359308 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
APOFQ13790 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
APOFQ13790 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
APOFQ13790 C12orf76-205ENST00000548191 2204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
APOFQ13790 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
APOFQ13790 POU2F2-216ENST00000560558 3282 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
APOFQ13790 MSNP1-201ENST00000511640 1732 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
APOFQ13790 ILDR1-201ENST00000273691 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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APOFQ13790 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
APOFQ13790 RPS15A-213ENST00000576436 2190 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
APOFQ13790 RAB37-203ENST00000392612 2528 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
APOFQ13790 C9orf170-201ENST00000623052 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
APOFQ13790 SLC28A1-201ENST00000286749 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
APOFQ13790 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
APOFQ13790 BEND6-202ENST00000370746 2379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
APOFQ13790 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
APOFQ13790 SCNN1B-202ENST00000343070 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
APOFQ13790 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
APOFQ13790 TPO-202ENST00000345913 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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APOFQ13790 CDCA3-202ENST00000422785 2760 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
APOFQ13790 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
APOFQ13790 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
APOFQ13790 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
APOFQ13790 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
APOFQ13790 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
APOFQ13790 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
APOFQ13790 GNAL-203ENST00000423027 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
APOFQ13790 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
APOFQ13790 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
APOFQ13790 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
APOFQ13790 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
APOFQ13790 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
APOFQ13790 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
APOFQ13790 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
APOFQ13790 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
APOFQ13790 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
APOFQ13790 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
APOFQ13790 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
APOFQ13790 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
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