Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms