Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
FOXF2Q12947 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
FOXF2Q12947 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
FOXF2Q12947 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
FOXF2Q12947 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
FOXF2Q12947 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXF2Q12947 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXF2Q12947 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXF2Q12947 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXF2Q12947 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXF2Q12947 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXF2Q12947 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXF2Q12947 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXF2Q12947 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXF2Q12947 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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FOXF2Q12947 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXF2Q12947 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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FOXF2Q12947 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXF2Q12947 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXF2Q12947 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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FOXF2Q12947 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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FOXF2Q12947 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXF2Q12947 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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FOXF2Q12947 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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FOXF2Q12947 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXF2Q12947 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXF2Q12947 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXF2Q12947 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXF2Q12947 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXF2Q12947 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXF2Q12947 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXF2Q12947 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXF2Q12947 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXF2Q12947 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXF2Q12947 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXF2Q12947 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXF2Q12947 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXF2Q12947 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXF2Q12947 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
FOXF2Q12947 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
FOXF2Q12947 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
FOXF2Q12947 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
FOXF2Q12947 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FOXF2Q12947 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
FOXF2Q12947 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FOXF2Q12947 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FOXF2Q12947 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
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