Protein–RNA interactions for Protein: Q10587

TEF, Thyrotroph embryonic factor, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TEFQ10587 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TEFQ10587 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TEFQ10587 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TEFQ10587 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TEFQ10587 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TEFQ10587 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TEFQ10587 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TEFQ10587 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TEFQ10587 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TEFQ10587 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TEFQ10587 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TEFQ10587 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TEFQ10587 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TEFQ10587 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TEFQ10587 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TEFQ10587 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TEFQ10587 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TEFQ10587 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TEFQ10587 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TEFQ10587 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TEFQ10587 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TEFQ10587 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TEFQ10587 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TEFQ10587 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TEFQ10587 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TEFQ10587 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
TEFQ10587 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TEFQ10587 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TEFQ10587 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TEFQ10587 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TEFQ10587 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TEFQ10587 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TEFQ10587 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TEFQ10587 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TEFQ10587 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TEFQ10587 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TEFQ10587 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TEFQ10587 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TEFQ10587 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TEFQ10587 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TEFQ10587 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TEFQ10587 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TEFQ10587 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TEFQ10587 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TEFQ10587 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TEFQ10587 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TEFQ10587 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TEFQ10587 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TEFQ10587 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TEFQ10587 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TEFQ10587 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TEFQ10587 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TEFQ10587 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TEFQ10587 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TEFQ10587 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TEFQ10587 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TEFQ10587 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TEFQ10587 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TEFQ10587 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TEFQ10587 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TEFQ10587 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TEFQ10587 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TEFQ10587 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TEFQ10587 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TEFQ10587 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TEFQ10587 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TEFQ10587 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TEFQ10587 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TEFQ10587 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TEFQ10587 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TEFQ10587 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TEFQ10587 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TEFQ10587 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TEFQ10587 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TEFQ10587 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TEFQ10587 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TEFQ10587 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TEFQ10587 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TEFQ10587 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TEFQ10587 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TEFQ10587 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TEFQ10587 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TEFQ10587 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TEFQ10587 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TEFQ10587 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TEFQ10587 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TEFQ10587 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TEFQ10587 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TEFQ10587 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TEFQ10587 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TEFQ10587 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TEFQ10587 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TEFQ10587 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TEFQ10587 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TEFQ10587 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TEFQ10587 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TEFQ10587 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TEFQ10587 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TEFQ10587 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TEFQ10587 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms