Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC14.03□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC14.03□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC14.03□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC14.03□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
MC1RQ01726 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
MC1RQ01726 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
MC1RQ01726 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
MC1RQ01726 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
MC1RQ01726 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
MC1RQ01726 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
MC1RQ01726 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
MC1RQ01726 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
MC1RQ01726 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
MC1RQ01726 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
MC1RQ01726 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
MC1RQ01726 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
MC1RQ01726 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
MC1RQ01726 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
MC1RQ01726 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
MC1RQ01726 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
MC1RQ01726 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
MC1RQ01726 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
MC1RQ01726 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
MC1RQ01726 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
MC1RQ01726 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
MC1RQ01726 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
MC1RQ01726 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
MC1RQ01726 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.2 ms