Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 PDP1-202ENST00000396200 4358 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC12.43□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 LINC00908-202ENST00000578613 2242 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 DCDC2-202ENST00000378454 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 ACIN1-222ENST00000557515 2751 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 GPC3-201ENST00000370818 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 TMEM199-201ENST00000292114 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 ATP1A1-201ENST00000295598 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 GK-205ENST00000378946 3638 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 DMBX1-201ENST00000360032 2880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 FGFR2-212ENST00000369060 3244 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 AC245100.6-201ENST00000427169 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 MEG3-214ENST00000519709 1726 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 OSBPL7-202ENST00000392507 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 ANKRD27-204ENST00000587352 3301 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 MATR3-227ENST00000618441 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 CYP11B1-204ENST00000517471 1874 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 MIS12-202ENST00000573759 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 CCDC88A-214ENST00000621814 3089 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 AL135999.1-201ENST00000555968 3243 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 BISPR-204ENST00000634675 1806 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 GRM8-201ENST00000339582 4057 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 PRPF40B-202ENST00000380281 3154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 SLC5A9-203ENST00000438567 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 DDX54-201ENST00000306014 4377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 GNAS-214ENST00000371100 4029 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 PSAP-201ENST00000394934 2830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC12.42□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC12.42□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 AC018645.3-201ENST00000628855 2646 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 PRR3-201ENST00000376557 1797 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 DNAJB12-204ENST00000461919 2369 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 ELMOD3-202ENST00000393852 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 ZFHX2-AS1-201ENST00000553985 2322 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 PRKCQ-203ENST00000539722 3224 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 TP53I11-203ENST00000395648 3381 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 TJP2-206ENST00000453658 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 PRAMENP-201ENST00000337471 3038 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 ARHGEF9-220ENST00000635729 1761 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 SUCLG2-201ENST00000307227 2352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 FBLN2-207ENST00000492059 4193 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms