Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC12.53□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
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