Protein–RNA interactions for Protein: P67936

TPM4, Tropomyosin alpha-4 chain, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM4P67936 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TPM4P67936 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TPM4P67936 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TPM4P67936 GNL1-201ENST00000376621 7490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TPM4P67936 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TPM4P67936 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TPM4P67936 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TPM4P67936 AC011481.3-201ENST00000623895 5594 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TPM4P67936 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TPM4P67936 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TPM4P67936 KIAA0513-201ENST00000258180 7404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TPM4P67936 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TPM4P67936 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TPM4P67936 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TPM4P67936 TLR6-202ENST00000436693 5880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TPM4P67936 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TPM4P67936 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TPM4P67936 AJAP1-202ENST00000378191 11666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TPM4P67936 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TPM4P67936 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TPM4P67936 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TPM4P67936 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TPM4P67936 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TPM4P67936 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TPM4P67936 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TPM4P67936 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TPM4P67936 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TPM4P67936 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TPM4P67936 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TPM4P67936 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TPM4P67936 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TPM4P67936 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TPM4P67936 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TPM4P67936 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TPM4P67936 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TPM4P67936 ZCCHC8-207ENST00000543897 5663 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TPM4P67936 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TPM4P67936 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TPM4P67936 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TPM4P67936 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TPM4P67936 CSNK1G3-201ENST00000345990 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TPM4P67936 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TPM4P67936 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TPM4P67936 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TPM4P67936 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TPM4P67936 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TPM4P67936 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TPM4P67936 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TPM4P67936 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TPM4P67936 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TPM4P67936 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TPM4P67936 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TPM4P67936 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TPM4P67936 SPTBN2-201ENST00000309996 7866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TPM4P67936 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TPM4P67936 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPM4P67936 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPM4P67936 RERE-201ENST00000337907 8026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPM4P67936 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPM4P67936 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPM4P67936 DHX34-201ENST00000328771 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPM4P67936 IRAK1BP1-201ENST00000369940 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPM4P67936 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPM4P67936 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPM4P67936 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPM4P67936 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPM4P67936 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPM4P67936 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPM4P67936 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPM4P67936 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPM4P67936 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPM4P67936 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPM4P67936 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPM4P67936 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPM4P67936 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TPM4P67936 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPM4P67936 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPM4P67936 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TPM4P67936 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TPM4P67936 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TPM4P67936 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPM4P67936 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TPM4P67936 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPM4P67936 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPM4P67936 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPM4P67936 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPM4P67936 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPM4P67936 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPM4P67936 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPM4P67936 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPM4P67936 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPM4P67936 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPM4P67936 LRRC8A-203ENST00000372600 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPM4P67936 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPM4P67936 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPM4P67936 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPM4P67936 ARAP1-204ENST00000393609 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPM4P67936 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TPM4P67936 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPM4P67936 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms