Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
LOXL3P58215 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LOXL3P58215 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LOXL3P58215 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LOXL3P58215 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
LOXL3P58215 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LOXL3P58215 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LOXL3P58215 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LOXL3P58215 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LOXL3P58215 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LOXL3P58215 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
LOXL3P58215 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
LOXL3P58215 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
LOXL3P58215 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LOXL3P58215 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LOXL3P58215 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LOXL3P58215 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LOXL3P58215 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LOXL3P58215 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LOXL3P58215 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LOXL3P58215 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LOXL3P58215 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LOXL3P58215 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LOXL3P58215 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
LOXL3P58215 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LOXL3P58215 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LOXL3P58215 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LOXL3P58215 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LOXL3P58215 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LOXL3P58215 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LOXL3P58215 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LOXL3P58215 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms