Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSCP56915 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSCP56915 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSCP56915 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSCP56915 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSCP56915 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GSCP56915 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSCP56915 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GSCP56915 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSCP56915 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSCP56915 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSCP56915 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GSCP56915 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSCP56915 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSCP56915 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSCP56915 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSCP56915 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GSCP56915 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GSCP56915 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSCP56915 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSCP56915 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSCP56915 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSCP56915 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSCP56915 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSCP56915 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSCP56915 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSCP56915 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSCP56915 CNKSR3-204ENST00000479339 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSCP56915 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSCP56915 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSCP56915 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSCP56915 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSCP56915 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSCP56915 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GSCP56915 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GSCP56915 AC134407.3-201ENST00000624035 2139 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GSCP56915 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GSCP56915 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GSCP56915 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GSCP56915 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GSCP56915 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GSCP56915 TJAP1-205ENST00000372452 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GSCP56915 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GSCP56915 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GSCP56915 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GSCP56915 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GSCP56915 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GSCP56915 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GSCP56915 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GSCP56915 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GSCP56915 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GSCP56915 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GSCP56915 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GSCP56915 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GSCP56915 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GSCP56915 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GSCP56915 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GSCP56915 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GSCP56915 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GSCP56915 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GSCP56915 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GSCP56915 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GSCP56915 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GSCP56915 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GSCP56915 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GSCP56915 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GSCP56915 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GSCP56915 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GSCP56915 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GSCP56915 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GSCP56915 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GSCP56915 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GSCP56915 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GSCP56915 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GSCP56915 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GSCP56915 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GSCP56915 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GSCP56915 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GSCP56915 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GSCP56915 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GSCP56915 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GSCP56915 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GSCP56915 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GSCP56915 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GSCP56915 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GSCP56915 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GSCP56915 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GSCP56915 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GSCP56915 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GSCP56915 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GSCP56915 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GSCP56915 PTPN5-203ENST00000396168 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GSCP56915 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GSCP56915 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GSCP56915 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GSCP56915 SPTBN2-210ENST00000611817 2890 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GSCP56915 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GSCP56915 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GSCP56915 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GSCP56915 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms