Protein–RNA interactions for Protein: P55145

MANF, Mesencephalic astrocyte-derived neurotrophic factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MANFP55145 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MANFP55145 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
MANFP55145 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MANFP55145 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MANFP55145 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
MANFP55145 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MANFP55145 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MANFP55145 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MANFP55145 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MANFP55145 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MANFP55145 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MANFP55145 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MANFP55145 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MANFP55145 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MANFP55145 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MANFP55145 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MANFP55145 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MANFP55145 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MANFP55145 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MANFP55145 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MANFP55145 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MANFP55145 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MANFP55145 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
MANFP55145 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MANFP55145 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MANFP55145 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MANFP55145 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MANFP55145 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MANFP55145 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MANFP55145 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MANFP55145 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MANFP55145 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MANFP55145 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MANFP55145 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MANFP55145 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MANFP55145 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MANFP55145 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MANFP55145 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MANFP55145 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
MANFP55145 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MANFP55145 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MANFP55145 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MANFP55145 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MANFP55145 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MANFP55145 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MANFP55145 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MANFP55145 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MANFP55145 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
MANFP55145 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MANFP55145 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
MANFP55145 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MANFP55145 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MANFP55145 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
MANFP55145 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
MANFP55145 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MANFP55145 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MANFP55145 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MANFP55145 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MANFP55145 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MANFP55145 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MANFP55145 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MANFP55145 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MANFP55145 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MANFP55145 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MANFP55145 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MANFP55145 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MANFP55145 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MANFP55145 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MANFP55145 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MANFP55145 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MANFP55145 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MANFP55145 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MANFP55145 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MANFP55145 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MANFP55145 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MANFP55145 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MANFP55145 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MANFP55145 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MANFP55145 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MANFP55145 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MANFP55145 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MANFP55145 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MANFP55145 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MANFP55145 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MANFP55145 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MANFP55145 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MANFP55145 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MANFP55145 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MANFP55145 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
MANFP55145 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MANFP55145 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MANFP55145 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MANFP55145 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MANFP55145 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MANFP55145 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MANFP55145 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
MANFP55145 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MANFP55145 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MANFP55145 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MANFP55145 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms