Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms