Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 BX248123.1-201ENST00000429070 606 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 FOXP4-AS1-205ENST00000454812 575 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 AC092903.1-201ENST00000466506 262 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 ZNF737-204ENST00000596797 569 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 AC005274.1-201ENST00000623460 802 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 LCN6-201ENST00000341206 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 AC074389.3-201ENST00000450458 454 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 AC117945.1-201ENST00000451375 463 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 HNRNPA1P16-201ENST00000575692 955 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.2 ms