Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMPOP42166 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMPOP42166 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMPOP42166 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMPOP42166 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMPOP42166 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMPOP42166 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMPOP42166 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMPOP42166 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMPOP42166 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMPOP42166 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMPOP42166 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMPOP42166 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TMPOP42166 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMPOP42166 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMPOP42166 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMPOP42166 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMPOP42166 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMPOP42166 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMPOP42166 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMPOP42166 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMPOP42166 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMPOP42166 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMPOP42166 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMPOP42166 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMPOP42166 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMPOP42166 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMPOP42166 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMPOP42166 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMPOP42166 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMPOP42166 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMPOP42166 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMPOP42166 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMPOP42166 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TMPOP42166 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMPOP42166 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMPOP42166 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMPOP42166 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TMPOP42166 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMPOP42166 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMPOP42166 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMPOP42166 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMPOP42166 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMPOP42166 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMPOP42166 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMPOP42166 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMPOP42166 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMPOP42166 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMPOP42166 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMPOP42166 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TMPOP42166 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
TMPOP42166 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMPOP42166 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMPOP42166 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMPOP42166 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMPOP42166 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMPOP42166 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMPOP42166 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMPOP42166 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMPOP42166 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMPOP42166 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMPOP42166 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMPOP42166 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMPOP42166 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMPOP42166 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TMPOP42166 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TMPOP42166 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMPOP42166 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TMPOP42166 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TMPOP42166 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMPOP42166 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMPOP42166 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMPOP42166 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMPOP42166 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMPOP42166 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TMPOP42166 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMPOP42166 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMPOP42166 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMPOP42166 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TMPOP42166 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMPOP42166 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TMPOP42166 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMPOP42166 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMPOP42166 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMPOP42166 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMPOP42166 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMPOP42166 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMPOP42166 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMPOP42166 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMPOP42166 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMPOP42166 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMPOP42166 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMPOP42166 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMPOP42166 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMPOP42166 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMPOP42166 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMPOP42166 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMPOP42166 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMPOP42166 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMPOP42166 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms