Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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HOXD12P35452 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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HOXD12P35452 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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HOXD12P35452 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXD12P35452 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.1
HOXD12P35452 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
HOXD12P35452 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
HOXD12P35452 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
HOXD12P35452 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
HOXD12P35452 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
HOXD12P35452 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
HOXD12P35452 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXD12P35452 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXD12P35452 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXD12P35452 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXD12P35452 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXD12P35452 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXD12P35452 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXD12P35452 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXD12P35452 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXD12P35452 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXD12P35452 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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