Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms