Protein–RNA interactions for Protein: P21399

ACO1, Cytoplasmic aconitate hydratase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACO1P21399 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACO1P21399 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACO1P21399 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACO1P21399 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACO1P21399 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACO1P21399 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACO1P21399 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACO1P21399 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACO1P21399 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACO1P21399 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACO1P21399 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACO1P21399 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ACO1P21399 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACO1P21399 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACO1P21399 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACO1P21399 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACO1P21399 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACO1P21399 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACO1P21399 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACO1P21399 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACO1P21399 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACO1P21399 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACO1P21399 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACO1P21399 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACO1P21399 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACO1P21399 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACO1P21399 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACO1P21399 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACO1P21399 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACO1P21399 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACO1P21399 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACO1P21399 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACO1P21399 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACO1P21399 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACO1P21399 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACO1P21399 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACO1P21399 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACO1P21399 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACO1P21399 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACO1P21399 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACO1P21399 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACO1P21399 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ACO1P21399 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACO1P21399 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACO1P21399 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACO1P21399 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ACO1P21399 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACO1P21399 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACO1P21399 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACO1P21399 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACO1P21399 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACO1P21399 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACO1P21399 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ACO1P21399 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ACO1P21399 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACO1P21399 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACO1P21399 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACO1P21399 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACO1P21399 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACO1P21399 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACO1P21399 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACO1P21399 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ACO1P21399 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACO1P21399 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ACO1P21399 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACO1P21399 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ACO1P21399 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACO1P21399 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACO1P21399 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACO1P21399 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACO1P21399 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACO1P21399 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACO1P21399 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACO1P21399 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACO1P21399 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACO1P21399 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACO1P21399 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACO1P21399 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACO1P21399 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACO1P21399 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACO1P21399 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACO1P21399 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACO1P21399 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACO1P21399 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACO1P21399 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACO1P21399 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACO1P21399 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACO1P21399 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACO1P21399 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACO1P21399 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACO1P21399 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACO1P21399 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACO1P21399 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACO1P21399 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACO1P21399 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACO1P21399 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACO1P21399 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACO1P21399 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACO1P21399 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACO1P21399 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms