Protein–RNA interactions for Protein: P20382

PMCH, Pro-MCH, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHP20382 SMG6-201ENST00000263073 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PMCHP20382 PRRG4-201ENST00000257836 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PMCHP20382 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PMCHP20382 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PMCHP20382 FAM225B-201ENST00000423546 5629 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PMCHP20382 TP73-206ENST00000378288 5120 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PMCHP20382 SFTPA1-202ENST00000419470 2210 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PMCHP20382 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PMCHP20382 ZFAND3-203ENST00000373391 3001 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PMCHP20382 ZNF799-202ENST00000430385 2583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PMCHP20382 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PMCHP20382 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PMCHP20382 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PMCHP20382 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PMCHP20382 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PMCHP20382 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PMCHP20382 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PMCHP20382 MAP2K4P1-202ENST00000602584 2539 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PMCHP20382 ACSF3-201ENST00000317447 3664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PMCHP20382 NBPF1-203ENST00000430580 5932 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PMCHP20382 NPR3-201ENST00000265074 7344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PMCHP20382 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PMCHP20382 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PMCHP20382 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PMCHP20382 LRRC8A-201ENST00000259324 4619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PMCHP20382 RPL27A-201ENST00000314138 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PMCHP20382 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PMCHP20382 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PMCHP20382 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PMCHP20382 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PMCHP20382 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PMCHP20382 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PMCHP20382 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PMCHP20382 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PMCHP20382 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PMCHP20382 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PMCHP20382 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PMCHP20382 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PMCHP20382 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
PMCHP20382 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PMCHP20382 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PMCHP20382 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
PMCHP20382 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PMCHP20382 SAP30BP-225ENST00000584667 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PMCHP20382 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PMCHP20382 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PMCHP20382 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PMCHP20382 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PMCHP20382 DGKZ-216ENST00000528615 2692 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PMCHP20382 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PMCHP20382 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PMCHP20382 PRR3-202ENST00000376560 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PMCHP20382 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PMCHP20382 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PMCHP20382 PCDHB4-201ENST00000194152 3825 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PMCHP20382 SRSF1-205ENST00000582730 3117 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PMCHP20382 COL4A6-209ENST00000545689 6380 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PMCHP20382 HSPA2-201ENST00000247207 2767 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PMCHP20382 TTC39B-201ENST00000297615 3053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PMCHP20382 EPHA1-201ENST00000275815 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PMCHP20382 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PMCHP20382 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PMCHP20382 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PMCHP20382 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PMCHP20382 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PMCHP20382 DNM3-208ENST00000627582 7625 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PMCHP20382 P2RY8-201ENST00000381297 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PMCHP20382 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PMCHP20382 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PMCHP20382 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PMCHP20382 LLGL1-203ENST00000621229 3187 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PMCHP20382 CCT6P3-201ENST00000419314 3702 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PMCHP20382 ZBTB20-211ENST00000471418 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PMCHP20382 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PMCHP20382 FAM90A11P-201ENST00000518378 2218 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
PMCHP20382 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PMCHP20382 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PMCHP20382 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PMCHP20382 NPR2-201ENST00000342694 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PMCHP20382 MAP7-208ENST00000617204 4536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PMCHP20382 ATP8A1-202ENST00000381668 8270 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PMCHP20382 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PMCHP20382 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PMCHP20382 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PMCHP20382 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PMCHP20382 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PMCHP20382 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PMCHP20382 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
PMCHP20382 WDR62-203ENST00000401500 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PMCHP20382 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PMCHP20382 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
PMCHP20382 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PMCHP20382 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PMCHP20382 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PMCHP20382 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PMCHP20382 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PMCHP20382 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PMCHP20382 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PMCHP20382 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
PMCHP20382 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms