Protein–RNA interactions for Protein: P19113

HDC, Histidine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 662 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDCP19113 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HDCP19113 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HDCP19113 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HDCP19113 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HDCP19113 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HDCP19113 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HDCP19113 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HDCP19113 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDCP19113 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDCP19113 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HDCP19113 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HDCP19113 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HDCP19113 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDCP19113 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HDCP19113 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HDCP19113 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDCP19113 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDCP19113 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDCP19113 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HDCP19113 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDCP19113 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDCP19113 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDCP19113 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HDCP19113 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDCP19113 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDCP19113 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HDCP19113 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDCP19113 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDCP19113 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDCP19113 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDCP19113 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDCP19113 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HDCP19113 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDCP19113 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HDCP19113 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDCP19113 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDCP19113 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HDCP19113 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDCP19113 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDCP19113 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDCP19113 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDCP19113 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
HDCP19113 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDCP19113 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDCP19113 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDCP19113 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HDCP19113 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDCP19113 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HDCP19113 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HDCP19113 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
HDCP19113 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HDCP19113 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HDCP19113 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDCP19113 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HDCP19113 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HDCP19113 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDCP19113 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HDCP19113 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDCP19113 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDCP19113 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HDCP19113 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HDCP19113 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HDCP19113 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDCP19113 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDCP19113 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDCP19113 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HDCP19113 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HDCP19113 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HDCP19113 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HDCP19113 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HDCP19113 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
HDCP19113 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HDCP19113 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HDCP19113 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HDCP19113 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HDCP19113 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HDCP19113 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HDCP19113 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HDCP19113 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HDCP19113 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HDCP19113 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HDCP19113 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HDCP19113 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HDCP19113 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HDCP19113 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC15.02■□□□□ -0
HDCP19113 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC15.02■□□□□ -0
HDCP19113 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HDCP19113 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HDCP19113 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
HDCP19113 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HDCP19113 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HDCP19113 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HDCP19113 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HDCP19113 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HDCP19113 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC15.02■□□□□ -0
HDCP19113 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HDCP19113 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HDCP19113 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC15.02■□□□□ -0
HDCP19113 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HDCP19113 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms