Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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