Protein–RNA interactions for Protein: P11712

CYP2C9, Cytochrome P450 2C9, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C9P11712 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYP2C9P11712 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYP2C9P11712 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYP2C9P11712 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYP2C9P11712 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYP2C9P11712 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYP2C9P11712 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYP2C9P11712 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYP2C9P11712 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYP2C9P11712 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYP2C9P11712 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYP2C9P11712 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYP2C9P11712 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CYP2C9P11712 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYP2C9P11712 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYP2C9P11712 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYP2C9P11712 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYP2C9P11712 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYP2C9P11712 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYP2C9P11712 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CYP2C9P11712 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CYP2C9P11712 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CYP2C9P11712 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CYP2C9P11712 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYP2C9P11712 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYP2C9P11712 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYP2C9P11712 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYP2C9P11712 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYP2C9P11712 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYP2C9P11712 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYP2C9P11712 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYP2C9P11712 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYP2C9P11712 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYP2C9P11712 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYP2C9P11712 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYP2C9P11712 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYP2C9P11712 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYP2C9P11712 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYP2C9P11712 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYP2C9P11712 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYP2C9P11712 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYP2C9P11712 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYP2C9P11712 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYP2C9P11712 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYP2C9P11712 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CYP2C9P11712 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CYP2C9P11712 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CYP2C9P11712 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
CYP2C9P11712 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CYP2C9P11712 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CYP2C9P11712 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CYP2C9P11712 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 163.1 ms