Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

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Length 197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 CST1-202ENST00000398402 655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 AC078785.1-204ENST00000460707 764 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 PAQR9-AS1-203ENST00000497652 516 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 KNOP1P1-201ENST00000542108 989 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 AC009065.6-201ENST00000568795 456 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 LINC01869-204ENST00000635639 1047 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 SULT2A1-201ENST00000222002 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 C21orf62-AS1-201ENST00000382375 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 AC122719.1-201ENST00000507989 559 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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