Protein–RNA interactions for Protein: O43909

EXTL3, Exostosin-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL3O43909 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms