Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CREB3O43889 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CREB3O43889 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CREB3O43889 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CREB3O43889 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CREB3O43889 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CREB3O43889 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CREB3O43889 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CREB3O43889 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CREB3O43889 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CREB3O43889 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CREB3O43889 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CREB3O43889 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CREB3O43889 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CREB3O43889 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CREB3O43889 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CREB3O43889 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CREB3O43889 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CREB3O43889 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CREB3O43889 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CREB3O43889 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CREB3O43889 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CREB3O43889 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CREB3O43889 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CREB3O43889 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CREB3O43889 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CREB3O43889 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CREB3O43889 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CREB3O43889 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CREB3O43889 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CREB3O43889 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CREB3O43889 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CREB3O43889 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CREB3O43889 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CREB3O43889 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CREB3O43889 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CREB3O43889 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CREB3O43889 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CREB3O43889 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CREB3O43889 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CREB3O43889 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CREB3O43889 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CREB3O43889 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CREB3O43889 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CREB3O43889 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CREB3O43889 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CREB3O43889 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CREB3O43889 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CREB3O43889 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CREB3O43889 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CREB3O43889 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CREB3O43889 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CREB3O43889 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CREB3O43889 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CREB3O43889 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CREB3O43889 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CREB3O43889 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CREB3O43889 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CREB3O43889 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CREB3O43889 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CREB3O43889 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CREB3O43889 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CREB3O43889 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CREB3O43889 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CREB3O43889 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CREB3O43889 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CREB3O43889 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CREB3O43889 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CREB3O43889 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CREB3O43889 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CREB3O43889 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CREB3O43889 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CREB3O43889 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CREB3O43889 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CREB3O43889 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CREB3O43889 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CREB3O43889 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CREB3O43889 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CREB3O43889 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CREB3O43889 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CREB3O43889 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREB3O43889 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREB3O43889 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREB3O43889 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREB3O43889 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREB3O43889 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREB3O43889 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREB3O43889 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREB3O43889 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREB3O43889 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREB3O43889 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREB3O43889 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREB3O43889 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREB3O43889 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREB3O43889 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREB3O43889 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREB3O43889 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREB3O43889 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREB3O43889 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREB3O43889 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms