Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms