Protein–RNA interactions for Protein: A6NNA2

SRRM3, Serine/arginine repetitive matrix protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM3A6NNA2 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 Z98257.2-202ENST00000641138 1548 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 SLC2A14-213ENST00000539924 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SRRM3A6NNA2 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms