Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 IGHV3-66-201ENST00000390632 427 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 RPSAP6-201ENST00000417882 882 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 AL359182.1-201ENST00000435915 469 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 OR4C14P-201ENST00000440929 923 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 RN7SL69P-201ENST00000468423 272 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 RBFOX1-214ENST00000552089 1430 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 ART3-201ENST00000341029 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 AC098820.2-201ENST00000457694 666 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 TCEAL4-206ENST00000468024 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 TBC1D3P6-201ENST00000505954 962 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 AC008750.2-201ENST00000526996 627 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 ZFYVE1-206ENST00000555072 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 RXRG-201ENST00000359842 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 SNRPN-205ENST00000400100 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 RPL10-203ENST00000406022 748 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 PHBP10-201ENST00000416467 784 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 HNRNPA1P72-201ENST00000529511 967 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 AC009065.4-201ENST00000563734 543 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 AC026470.4-201ENST00000565812 308 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 AL031710.1-201ENST00000570022 468 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 AC087741.1-205ENST00000572730 750 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 CSRP2-201ENST00000311083 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 MRPL48-203ENST00000398483 1058 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 CSRP2-203ENST00000547435 632 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 FAM187B2P-201ENST00000577135 713 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 RCL1-206ENST00000442869 1644 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 U3.5-201ENST00000363448 216 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 RBP4-203ENST00000371469 814 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 AL162151.1-201ENST00000423922 561 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 LINC01824-201ENST00000436082 528 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 CCNL2P1-201ENST00000512846 969 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 AC103724.2-201ENST00000520355 476 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 URGCP-MRPS24-201ENST00000603700 795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 AC079331.1-201ENST00000623200 1200 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 CTLA4-201ENST00000295854 525 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 RNA5SP491-201ENST00000362936 118 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 CA5BP1-205ENST00000435806 1064 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 ZNRF4-201ENST00000222033 1426 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 DHRS7C-201ENST00000330255 1006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 AC245128.1-201ENST00000400864 1294 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 AL133351.2-201ENST00000437718 484 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 RN7SL838P-201ENST00000481676 295 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 AL445363.2-201ENST00000554608 837 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
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