Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms